影片的主要拍摄于2005年2月28日在洛衫矶开始,制作设计师里克·海恩里奇斯所要负责的除了大量丰富的背景之外,还有重新设计和建造的“黑珍珠”号、琼斯的“飞行荷兰人”号和英国商船“爱丁堡商人”号。其中“黑珍珠”号是在以造船厂和造船专家著称的阿拉巴马州的巴尤拉巴特尔(Bayou La Batre)建造,先是在电脑中完成设计图形,再请教舰船设计师和工程师,让“黑珍珠”号不但具备影片所要求的外观,还要具备充分的航海能力,有足够的实用价值。在《黑珍珠号的诅咒》中,“黑珍珠”号是在驳船上建造的,在续集中,“黑珍珠”号要成为一只真正的船。剧组物色到了109英尺长的“黄昏”号,这只船曾在墨西哥湾被用于维修钻井架,8个月后,在“黄昏”号的基础上,更性感、更酷的“黑珍珠”号呈现在剧组面前。
不过,罗西奥和艾利奥特拿出的剧本还是比较“规矩”的,虽然主题隐晦而尖锐--明显不是给孩子看的奇幻历险剧,但剧本中的杰克船长可没有大银幕上那般古怪另类,当然,这可全拜导演戈尔·维宾斯基和主演约翰尼·德普所赐,虽然两人当初并不知道将这个角色弄得如此疯癫如此古怪是否行得通,还是将风险一并承担下来。杰克船长结合了摇滚歌手基思·理查兹(Keith Richards)和有着法国腔的著名卡通形象臭鼬“Pepe Le Pew”的某些共性:生活不安定、性格狂野、想做就做、矛盾而混乱……约翰尼·德普表示自己并非单纯地模仿理查兹的动作,而是抓住了其中的神髓,那是一种美丽又懒散的自信,眼睛上的浓眼影、头发上的连串珠子,都是“自由”的标志--“海盗”一词在德普的心中就代表着“绝对的自由”,感觉就像是18世纪的摇滚明星。于是他诠释的杰克船长就这样变成了一个精明的冒险家,有着轻松快乐、不加停顿的圆滑腔调,说着像妇人一样阴柔狡诈的花言巧语,走起路来摇曳生风--这些都令迪斯尼公司的行政长官们牙齿不停地打颤,说德普一个人就可以毁掉这部耗资巨大的影片,还嘲笑他的杰克船长看起来就像是个基佬。